Construídos a partir de 1900, tiveram suas obras concluídas em 1930, tendo como alicerce as pedras retiradas do Morro da Cruz, do desmonte do Morro da Atalaia (os molhes do Sul), e do material do Morro das Pedreiras, em Navegantes (os molhes do Norte). Foram os Molhes da Barra que fixaram o canal de acesso ao porto permitindo a atracagem dos navios, tornando segura a navegação no canal marítimo entre Itajaí e Navegantes. Dois faróis situados na ponta dos molhes mar adentro, sinalizam a entrada do canal, lugar do encontro entre o rio Itajaí-Açu e o oceano Atlântico.